1. 全身性細菌感染症
一般罹患全身性細菌感染症的母蝦在進入繁殖池後，1~2天就會有死亡現象之發生，而死亡的現象在産卵後更加嚴重，因爲産卵後母蝦之體能消耗甚大，促使發病之機率上升。這些發生症狀的母蝦大部分皆體軀轉紅，尤其是鰓部更變爲赤紅或鮮紅色，若再檢查其肝胰臓，初期會明顯的腫大而變紅，而後逐漸變爲白濁而萎縮，並産生很多粘稠的液體，繼之肝胰臓細胞會有硬化或崩解的現象，將這些肝胰臓進行組織病理之檢查，則可看到肝臓産生很多肉芽腫，並有些細胞已因細菌之侵襲而崩解成空泡狀。組織病理上之觀察結果，確實都由細胞所引起。赤紅的鰓部更會有水種的現象。有些罹病而致死的母蝦，雖全身及鰓部泛紅，但肝胰臓卻不易用肉眼觀察出病變，若將此肝胰臓進行組織病理切之觀察，則可看到其細胞大部分已受細菌之侵襲，而破裂或分解。
2. 殼病
種蝦由於必須經過多次的搬運，在人爲的操作過程中，使得種蝦所承受的緊迫增加，可能會使蝦體體表原有的小病灶轉趨嚴重，甚至造成體表新的病灶産生。這些體表的傷口可能由於水中的嗜幾丁質細菌包括弧菌，假單胞菌或粘液性細菌，尤其是絲狀菌等的感染，再加上種蝦池之水質變化不定，易使病情轉劇，甚而引發全身性的細菌性感染症，造成種蝦之死亡。
3. 營養與培育環境之不適症
種蝦會因爲營養的不調適，而發生長時間卵巢不成熟，所産生的蝦卵品質不佳之現象，此現象當然大大的降低種蝦的經濟價值。作爲繁殖用種蝦之飼育，與一般供食用之池蝦養殖方法不同，種蝦必須飼養於水質良好而澄清的池水內，若週遭環境不調適，對其存活、攝餌都有很大的影響，例如若將種蝦飼養于深色的池中母蝦體發現有不適應及死亡率會升高的迹象。
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