水中的微生物
自然界的水可分为地下水和地面水，除了地下深层水外，如湖泊，河流，海洋等各种地面水中都存在着各种各样的微生物。但它们所含的微生物种类，数量和分布都不相同。其中有些是“土生土长”的，例如自养菌中的硫磺细菌，硝化细菌，铁细菌，光合细菌等。异养菌中的假单胞杆菌，放线菌，真菌，原生动物及藻类。在水生细菌中革兰氏阴性杆菌最多（占95％），阳性菌占4％，而球菌只占1％。另一些水生细菌是外来的，它们来自土壤，空气，垃圾，工厂废物或城市下水道污水。来自前两者的微生物一般都是腐生性的，而来自下水道的微生物中， 很可能含有人体肠道致病菌，例如霍乱，伤寒，副伤寒和痢疾等病原菌。因此必须经过消毒处理才能作为饮用水。 水中微生物的种类和数量随水的来源及水中所含营养物和气候地理条件的不同而变化。其中影响最大的是水中有机物质的含量，如河流在留进城市前含菌量低，经过城市后汇集了大量污物，使含菌量大增，流出城市后含菌量又逐渐下降，沿岸与陆地毗邻的水中菌数较多，反之则越少，这种现象在大海更为明显，如果港口中的海水每毫升含菌10万个，则1～2千米外只含有500个，4千米外只有几十个甚至更少了。
水层的深度也影响微生物的分布，不论在淡水还是海水中细菌最多的地方不在水面，而在距水面5～10米处，此后逐渐减少，直至底部又有所增加。深层水中好氧微生物较少，厌氧和兼性厌氧的微生物较多。在几千米以下的深海中存在一些只能在几百个大气压下生长的嗜压微生物。
海水和淡水的差别在于含盐量，含盐量越多，则渗透压越大，反之则越少。因此海洋细菌和淡水中的细菌耐渗透压的能力相差很大，一般的海水和盐湖水中含盐量为4％，而死海的含盐量更高，但也有微生物生存着。例如在死海或其他含盐量高的海水中，存在着高度耐盐的细菌，如一种死海盐杆菌在18％至饱和盐水中均能生长，在15％盐水内仅略生长。而湖泊，河流中的微生物是厌盐的，在高于1％的盐水中就不能生长。
水中微生物的含量直接影响水的饮用价值，一般认为良好的饮用水中细菌数100个每毫升以下，如超过500个每毫升时，即不适合饮用。因此饮用微生物学检查中不仅要统计总菌数，还要检查病原菌数。由于病原菌数目很少，难以直接找到，一般根据病原菌大肠杆菌都来自粪便污染这一原理，通过检查大肠杆菌的数目来确定水源被粪便污染的程度，检查大肠杆菌可用伊红美兰等鉴别性培养基。根据我国政府所规定的饮用水卫生标准，自来水中细菌总数不可超过10个每毫升（37℃，培养24小时）。大肠杆菌不可超过3个每升。
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EM是“有效微生物群”的英文缩写。它是一种具有不同功能的光合细菌、乳酸菌、酵母菌、放线菌等10个属80余种微生物用特殊技法复合培养而成的生物制剂，由日本琉球大学比嘉照夫教授等经过多年潜心研究试制成功。EM在种植、养殖、环保和保健等方面所显示的非凡功能正日益受到人们的关注。
研究表明，EM具有消除臭味、净化环境、促进动植物生长、抑制病虫害等功能，故在日本被广泛应用于生活废水、垃圾的处理以及农业生产上。如将EM倒入下水道。会使污水净化、无臭；在生活垃圾中放入用EM制作的固体发酵物，发酵好的垃圾无臭、无毒，呈粉状，可直接肥田。用EM稀释放喷洒猪圈并拌入饲料喂猪，不但可去臭、除蝇，而且能提早出栏，提高猪内品田施用EM堆肥，能防；提高产量和品质。在花园使用EM,可减少化肥的用量，提高经济效益。另据报道，人经常服用EM稀释液，可以调整体内微生物的种类和数量比例，清除体内垃圾，减少疾病。
目前，EM除了在日本大面积推广外，在世界上尚有40多个国家和地区正在开始应用。我国对EM技术也非常重视，并在小范围内进行了试验，取得—定成效。据北京农业大学试验，在玉米地施用EM，增产幅度为8.6—36.8％；用EM喂养蛋鸡，产蛋量增加11.6％，鸡死亡率大大降低，而且鸡舍臭味明显降低。
专家们预言，在环境问题日趋严峻的今天，EM在种植、养殖、环保、保健等领域有着广阔的发展前景，EM在我国将成为生态农业的—项重要技术而得到广泛应用。
现在水族和水产养殖上已经出现不少EM产品。